Vakoiludraaman Punainen uhka keskiössä on nuori ja menestynyt CIA-analyytikko Alex O'Connor, joka saa tehtäväkseen selvittää, pitääkö venäläisen loikkarin tarina paikkansa. Alex ei kuitenkaan tiedä, että hänen vanhemmillaan on synkkä salaisuus. Alexin isä ja äiti ovat asuneet USA:ssa vuosikymmeniä, mutta ovat itse asiassa Neuvostoliiton aikoinaan värväämiä vakoojia. He ovat itsekin melkein jo unohtaneet taustansa, mutta nyt kun Alex on saanut huippuviran CIA:sta, vakoojapariskunnan entiset isännät kiinnostuvat perheestä aivan uudella lailla.